Marsa Mubarak abriga uma das últimas populações acessíveis de dugongos do Mar Vermelho, uma colônia de cerca de oito a doze indivíduos que pastam em prados de ervas marinhas entre o amanhecer e o meio da manhã. A baía obteve o status de proteção em 2004 sob o quadro de gestão costeira do Egito, restringindo a ancoragem de barcos e limitando o número diário de visitantes para preservar os frágeis bancos de Halodule e Halophila que sustentam esses mamíferos marinhos. Os dugongos, parentes dos peixes-boi, podem viver sessenta anos e exigem até quarenta quilos de ervas marinhas diariamente, tornando os baixios rasos e iluminados pelo sol de Marsa Mubarak um habitat essencial ao longo de uma costa onde a maioria dos bancos se degradou. O local atrai biólogos marinhos devido à sua densidade de tartarugas-verdes, que nidificam ao longo das praias adjacentes de maio a setembro e se alimentam durante todo o ano de algas presas aos recifes da baía. Os tours de snorkeling com dugongos em Marsa Alam operam sob licenças emitidas pela Autoridade de Protectorados do Mar Vermelho, com guias treinados para impor protocolos de não toque e manter distâncias de cinco metros da vida selvagem. A taxa de conservação financia patrulhas de guardas florestais e boias de amarração que evitam danos de âncoras na estrutura do recife, uma mistura de formações de Acropora, montes de Porites e jardins de corais moles que hospedam mais de duzentas espécies de peixes. A geografia de Marsa Mubarak cria condições ideais: a baía abre-se a sudoeste, protegida dos ventos predominantes do norte, e possui uma profundidade média de três a seis metros na maior parte da zona de snorkel. A clareza da água atinge o pico entre março e junho, muitas vezes excedendo trinta metros de visibilidade, embora os próprios prados de ervas marinhas ocupem águas mais rasas onde o sedimento reduz naturalmente a transparência. Os padrões de pastoreio dos dugongos seguem os ciclos de maré, com os animais se aproximando da costa durante a maré alta, quando os prados ficam totalmente submersos. Operadores locais realizam saídas para o tour de snorkeling com dugongos em Marsa Alam partindo de Port Ghalib e da cidade de Marsa Alam, normalmente chegando à baía em quarenta minutos de barco. A designação de área protegida proíbe a pesca e o uso de jet skis, mantendo a calma acústica que os dugongos exigem. Pesquisadores marcam os indivíduos periodicamente, e a fêmea residente da baía, identificada por um padrão de cicatriz em sua nadadeira esquerda, tem sido documentada aqui desde 2009, indicando uma fidelidade ao local a longo prazo que as medidas de conservação visam sustentar.